RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	IRAK2	O43187	625 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	GJA1	P17302	382 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	EPHA5	P54756	1037 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	CYP4F8	P98187	520 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	DEUP1	Q05D60	604 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	EFEMP1	Q12805	493 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC185	Q8N715	623 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	KIF18A	Q8NI77	898 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	ASAH2	Q9NR71	780 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RRN3	Q9NYV6	651 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	DPP7	Q9UHL4	492 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SNX12	Q9UMY4	172 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A1W2PRU2	124 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	COCH	O43405	550 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PSTPIP1	O43586	416 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RALA	P11233	206 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	MYL4	P12829	197 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	EFHB	Q8N7U6	833 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	COG1	Q8WTW3	980 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC22A12	Q96S37	553 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF38	Q9H0F5	515 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	CDH22	Q9UJ99	828 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC66	A2RUB6	948 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	KCNK3	O14649	394 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF185	O15231	689 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	MOSPD3	O75425	235 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PAPLN	O95428	1278 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RHO	P08100	348 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PTPN2	P17706	415 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	LRRC38	Q5VT99	294 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	TXNDC8	Q6A555	127 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	AADACL2	Q6P093	401 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	MIB1	Q86YT6	1006 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF276	Q8N554	614 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PRPSAP2	O60256	369 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	XYLB	O75191	536 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	POU2F2	P09086	479 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RARA	P10276	462 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PPP3CC	P48454	512 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	CXCR3	P49682	368 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	CA9	Q16790	459 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	HECTD3	Q5T447	861 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	TUB	P50607	506 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	POTEH	Q6S545	545 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	RAPGEF5	Q92565	580 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	APOL5	Q9BWW9	433 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PYGM	P11217	842 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	DES	P17661	470 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ADAM15	Q13444	863 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	HSPH1	Q92598	858 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC39A13	Q96H72	371 aa		18.46	■□□□□ 0.54

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