RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SNX15	Q9NRS6	342 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	VPS45	Q9NRW7	570 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	LUZP4	Q9P127	313 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	NFU1	Q9UMS0	254 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175		H7C1Q1	480 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SUV39H1	O43463	412 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CA12	O43570	354 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FAM155B	O75949	473 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	C1QL1	O75973	258 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PDE8B	O95263	885 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FSHB	P01225	129 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DRD1	P21728	446 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	GSTM5	P46439	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	AP2B1	P63010	937 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	GPC5	P78333	572 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PRKG1	Q13976	671 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FAM187B	Q17R55	369 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	BTBD16	Q32M84	506 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DENND2C	Q68D51	928 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CEP85	Q6P2H3	762 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TTC30A	Q86WT1	665 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CERS3	Q8IU89	383 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SARAF	Q96BY9	339 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SNX18	Q96RF0	628 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MMS19	Q96T76	1030 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DUSP26	Q9BV47	211 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ASIC5	Q9NY37	505 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TLK1	Q9UKI8	766 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FZD4	Q9ULV1	537 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175		H3BNC9	293 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	PRAMEF2	O60811	474 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CER1	O95813	267 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MMP8	P22894	467 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	YY1	P25490	414 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	AKT1	P31749	480 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ARL4C	P56559	192 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CFHR3	Q02985	330 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SEMA3B	Q13214	749 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	FAM153C	Q494X1	144 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	C16orf89	Q6UX73	402 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RFX8	Q6ZV50	586 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	P3H2	Q8IVL5	708 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TERB1	Q8NA31	727 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	THAP4	Q8WY91	577 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	NPIPB3	Q92617	1050 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	CHFR	Q96EP1	664 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	VPS16	Q9H269	839 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	KLK15	Q9H2R5	256 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	DAPP1	Q9UN19	280 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATRX-223	ENST00000637175	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84

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