RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa2.7□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 KCNE2Q9Y6J6 123 aa2.7□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 U3KQE9 123 aa2.7□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 HMX2A2RU54 273 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 NDC80O14777 642 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MUSKO15146 869 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ADAM20O43506 726 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 EXOC3O60645 756 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 KERAO60938 352 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ENTPD3O75355 529 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 TAF5LO75529 589 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 RPP40O75818 363 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SEC14L2O76054 403 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CER1O95813 267 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 DBHP09172 617 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CCDC175P0C221 793 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ALAS1P13196 640 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 P4HA1P13674 534 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PNLIPP16233 465 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 LAG3P18627 525 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 THBS2P35442 1172 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 GP5P40197 560 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 KIR2DL3P43628 341 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ALDH1A3P47895 512 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 HSD17B4P51659 736 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ADAM17P78536 824 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 KRT17Q04695 432 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 KCNB1Q14721 858 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 KIR3DS1Q14943 382 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 NR1I3Q14994 352 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SLMAPQ14BN4 828 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MED22Q15528 200 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MSMPQ1L6U9 139 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 C2orf76Q3KRA6 126 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CRB2Q5IJ48 1285 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 RAB41Q5JT25 222 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ADALQ6DHV7 355 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 RAB12Q6IQ22 244 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SARM1Q6SZW1 724 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 LIPIQ6XZB0 460 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ETV3LQ6ZN32 361 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PROSER1Q86XN7 944 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 DNAAF5Q86Y56 855 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MIB1Q86YT6 1006 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ZFPM1Q8IX07 1006 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 RHOT2Q8IXI1 618 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SHISA5Q8N114 240 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CNTROBQ8N137 903 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 LRRC71Q8N4P6 559 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 POC5Q8NA72 575 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PLA2G15Q8NCC3 412 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SLC17A8Q8NDX2 589 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PDZD8Q8NEN9 1154 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 Q8NFD4 153 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MDM1Q8TC05 714 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ATP6V0A1Q93050 837 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PPP2R3CQ969Q6 453 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 FAM162AQ96A26 154 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 EXOC4Q96A65 974 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 TSPAN17Q96FV3 270 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 C5orf34Q96MH7 638 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 CMTM3Q96MX0 182 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 FSD1Q9BTV5 496 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 NDC1Q9BTX1 674 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 MRI1Q9BV20 369 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 ACAT2Q9BWD1 397 aa2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ATRX-220ENST00000635865 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms