RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 AMACRQ9UHK6 382 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RB1P06400 928 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ELF1P32519 619 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CA8P35219 290 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH1A3P47895 512 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MMRN1Q13201 1228 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC27Q6P3X3 843 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 BBS12Q6ZW61 710 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRED2Q7Z698 418 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TNS4Q8IZW8 715 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC26Q8TAB7 109 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF139Q8WU17 664 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 POF1BQ8WVV4 589 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP10Q92851 521 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEB5Q9BZ81 275 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 DCLK3Q9C098 648 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PCYOX1Q9UHG3 505 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 GBF1Q92538 1859 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 IRAK2O43187 625 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CSH1P0DML2 217 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CSH2P0DML3 217 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB1P25685 340 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRA1BP35368 520 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 COILP38432 576 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAPQ12770 1279 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNG2Q16589 344 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.737e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FAF2Q96CS3 445 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF157Q96PX1 679 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF670Q9BS34 389 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRG1O14668 218 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CST8O60676 142 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CA3P07451 260 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 FNTAP49354 379 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A5Q01650 507 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRA6Q6PI73 481 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MAATS1Q7Z4T9 603 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD7Q92527 254 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MYRFLQ96LU7 910 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RUNDC3BQ96NL0 473 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 WDCPQ9H6R7 721 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ANLNQ9NQW6 1124 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB21Q9UL25 225 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 INSL5Q9Y5Q6 135 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TGM5O43548 720 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ADH1AP07327 375 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RARGP13631 454 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR93Q6P2C0 686 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RFX6Q8HWS3 928 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG4AQ8WYN0 398 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TLR9Q9NR96 1032 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM51Q9NW97 253 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 STIM2Q9P246 746 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 I6L893 689 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBBP07437 444 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TWF1Q12792 350 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TFDP2Q14188 446 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 EFHC2Q5JST6 749 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PYROXD2Q8N2H3 581 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RUBCNQ92622 972 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD11Q96NU1 681 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB11Q96P15 392 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 HIDE1A8MVS5 230 aa25.83■■□□□ 1.73
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