RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	AREL1	O15033	823 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	MSH4	O15457	936 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC25A12	O75746	678 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	NPTXR	O95502	500 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANXA6	P08133	673 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RBP3	P10745	1247 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CYP2C9	P11712	490 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	PRG2	P13727	222 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	BNC1	Q01954	994 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SPIDR	Q14159	915 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TCEA2	Q15560	299 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145		M0QYT0	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CHN2	P52757	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	HK2	P52789	917 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	AP1S1	P61966	158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ABAT	P80404	500 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLD1	Q13393	1074 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	JAML	Q86YT9	394 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145		A0A0B4J269	797 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RAD51B	O15315	384 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCNB2	O95067	398 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	FGFR2	P21802	821 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CNTF	P26441	200 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	GSS	P48637	474 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RENBP	P51606	427 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RCAN1	P53805	252 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	MTAP	Q13126	283 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TUBB3	Q13509	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ANKRD28-215	ENST00000624145	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75

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