RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616558.4

SYTL1-210, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-210ENST00000616558 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 TAC4Q86UU9 113 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 SCML4Q8N228 414 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 PQLC3Q8N755 202 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 TMEM169Q96HH4 297 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF670Q9BS34 389 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.17■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 A0A1W2PQH9 124 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 CREB3O43889 395 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 EFCAB14O75071 495 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 VNN2O95498 520 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 IFNB1P01574 187 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 OR1D2P34982 312 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 MAGEA11P43364 429 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 CALCOCO2Q13137 446 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 NNTQ13423 1086 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ALLCQ8N6M5 410 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 BADQ92934 168 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 RNF34Q969K3 372 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ALPK3Q96L96 1907 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 MCF2LO15068 1137 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ARL4AP40617 200 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 EFHC2Q5JST6 749 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 SCD5Q86SK9 330 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 PLD5Q8N7P1 536 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 SNF8Q96H20 258 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 NMUR1Q9HB89 426 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.16■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 WDR27A2RRH5 827 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ITGAVP06756 1048 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 AMPD1P23109 780 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 ROR1Q01973 937 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 FAM71BQ8TC56 605 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 GIPC2Q8TF65 315 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 WDCPQ9H6R7 721 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 RRN3Q9NYV6 651 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 MTRRQ9UBK8 725 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.15■□□□□ 0.82
SYTL1-210ENST00000616558 H7C0C1 242 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 BAIAP3O94812 1187 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 EFEMP2O95967 443 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 RBP3P10745 1247 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ADRA1BP35368 520 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ATP5OP48047 213 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GDF10P55107 478 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 MTMR3Q13615 1198 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 CCDC89Q8N998 374 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAF2Q96CS3 445 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 GMIPQ9P107 970 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.14■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 F9P00740 461 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 LAG3P18627 525 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 DNAJB2P25686 324 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 KLRC2P26717 231 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ITGA8P53708 1063 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 NOMO1Q15155 1222 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 P3H1Q32P28 736 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 RNF139Q8WU17 664 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 OSER1Q9NX31 292 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 OGFRQ9NZT2 677 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 SCML2Q9UQR0 700 aa20.13■□□□□ 0.81
SYTL1-210ENST00000616558 PLXNA3P51805 1871 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms