RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 KLKB1P03952 638 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CFIP05156 583 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 RALAP11233 206 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 MXI1P50539 228 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXC1Q12948 553 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 DEFB124Q8NES8 71 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARID3AQ99856 593 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CD93Q9NPY3 652 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CISHQ9NSE2 258 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXO10Q9UK96 956 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF217O75362 1048 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF202O95125 648 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 HMBSP08397 361 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOXD12P35452 270 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF33AQ06730 810 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 EFEMP1Q12805 493 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAB20Q9NX57 234 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 WASF3Q9UPY6 502 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 WASH3PC4AMC7 463 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAD23BP54727 409 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 FYB2Q5VWT5 728 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 PIGZQ86VD9 579 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP76Q8TAP6 659 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 GFRA2O00451 464 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPINK2P20155 84 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 COG7P83436 770 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAB41Q5JT25 222 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTC39CQ8N584 583 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TATDN2Q93075 761 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CAPN10Q9HC96 672 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 AKAP13Q12802 2813 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CETN3O15182 167 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SERPINF2P08697 491 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 C1QTNF9P0C862 333 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHKAP35790 457 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 MFAP3P55082 362 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 GEN1Q17RS7 908 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCLK3Q9C098 648 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHD6Q8TD26 2715 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 STX10O60499 249 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 PROS1P07225 676 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 PNOCQ13519 176 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CBWD6Q4V339 395 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 DENND1CQ8IV53 801 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC32A1Q9H598 525 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCNX2A6NKB5 2137 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC12A8A0AV02 714 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TULP2O00295 520 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL12RB1P42701 662 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TKTL1P51854 596 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEMA3BQ13214 749 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 FUT11Q495W5 492 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms