RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 BAP1Q92560 729 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 CD101Q93033 1021 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 AZIN2Q96A70 460 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 SYT11Q9BT88 431 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 DCLK3Q9C098 648 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 NACA2Q9H009 215 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 MIS12Q9H081 205 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
BECN1-211ENST00000589636 DMDP11532 3685 aa16.21■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 H0Y858 1186 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SART1O43290 800 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 EGFP01133 1207 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 CISD3P0C7P0 127 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 HOXA6P31267 233 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 KRT9P35527 623 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NBL1P41271 181 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 GAD2Q05329 585 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NNTQ13423 1086 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 LRRC32Q14392 662 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 TAF5Q15542 800 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NFKBIBQ15653 356 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 FBXO43Q4G163 708 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 LUZP1Q86V48 1076 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PLD4Q96BZ4 506 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 HCN2Q9UL51 889 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 MYO6Q9UM54 1294 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.2■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SLC12A8A0AV02 714 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 ANTXRLA6NF34 631 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 K7ESF4 209 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 CACNG3O60359 315 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 LATS1O95835 1130 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 ADH1CP00326 375 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 ERBB2P04626 1255 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 MMEP08473 750 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SP9P0CG40 484 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 IRF1P10914 325 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 ADH5P11766 374 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SCNN1AP37088 669 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NOMO3P69849 1222 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 FMO1Q01740 532 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 CDR2Q01850 454 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 FYB2Q5VWT5 728 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PKN3Q6P5Z2 889 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 Q6ZS52 159 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NEK11Q8NG66 645 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 NT5C3BQ969T7 300 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 ST7Q9NRC1 585 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 MYO15AQ9UKN7 3530 aa16.19■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 GFPT2O94808 682 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 CHKAP35790 457 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PLA2G5P39877 138 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 STAT1P42224 750 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SLC6A3Q01959 620 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PTP4A2Q12974 167 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 FIGNQ5HY92 759 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 ARCQ7LC44 396 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 BNIPLQ7Z465 357 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PASD1Q8IV76 773 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 TTC16Q8NEE8 873 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 RNF139Q8WU17 664 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PNKPQ96T60 521 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.18■□□□□ 0.18
BECN1-211ENST00000589636 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms