RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 AMACRQ9UHK6 382 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 I6L893 689 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CXCL14O95715 111 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJB1P25685 340 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MMRN1Q13201 1228 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC70Q6NSX1 233 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 BBS12Q6ZW61 710 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP7D3Q8IWC1 876 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf54Q8WWF1 131 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD7Q92527 254 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 TCF25Q9BQ70 676 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ANLNQ9NQW6 1124 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CLIC5Q9NZA1 410 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXW11Q9UKB1 542 aa27.07■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 LAMA3Q16787 3333 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF487B1APH4 448 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 AIF1P55008 147 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC7A5Q01650 507 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 SCAPQ12770 1279 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT81Q14533 505 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MSANTD2Q6P1R3 559 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ATG4AQ8WYN0 398 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CASP10Q92851 521 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 FAF2Q96CS3 445 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF670Q9BS34 389 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 DCLK3Q9C098 648 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PCYOX1Q9UHG3 505 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB21Q9UL25 225 aa27.06■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 IRAK2O43187 625 aa27.05■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ADRA1BP35368 520 aa27.05■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PSEN1P49768 467 aa27.05■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 COILP38432 576 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 FNTAP49354 379 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 LILRA6Q6PI73 481 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PYROXD2Q8N2H3 581 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 POF1BQ8WVV4 589 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF157Q96PX1 679 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 STIM2Q9P246 746 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 NUDT5Q9UKK9 219 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 TGM5O43548 720 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CST8O60676 142 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CA3P07451 260 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CA8P35219 290 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ALDH1A3P47895 512 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 UBE3AQ05086 875 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CCNG2Q16589 344 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR93Q6P2C0 686 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF139Q8WU17 664 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MYRFLQ96LU7 910 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 HOMER3Q9NSC5 361 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 INSL5Q9Y5Q6 135 aa27.04■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PRRG1O14668 218 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RB1P06400 928 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CSH1P0DML2 217 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CSH2P0DML3 217 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 GBP1P32455 592 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ELF1P32519 619 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MAATS1Q7Z4T9 603 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 TLR9Q9NR96 1032 aa27.03■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 C2orf71A6NGG8 1288 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 HIDE1A8MVS5 230 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 TTI1O43156 1089 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ADH1AP07327 375 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RARGP13631 454 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PTGIRP43119 386 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 VSNL1P62760 191 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 CAMK1Q14012 370 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 RFX6Q8HWS3 928 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PQLC3Q8N755 202 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDH19Q8TAB3 1148 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 OVCA2Q8WZ82 227 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM118BQ9BPY3 351 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 WDCPQ9H6R7 721 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 MSI1O43347 362 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 ZMYND10O75800 440 aa27.02■■□□□ 1.92
SCAMP4-210ENST00000588555 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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