RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 HHIPQ96QV1 700 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PNKPQ96T60 521 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SYT11Q9BT88 431 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 NMUR1Q9HB89 426 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SPTBN2O15020 2390 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1W2PQH9 124 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SMTNL1A8MU46 457 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 AXIN1O15169 862 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 GREM1O60565 184 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 KAT7O95251 611 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 APBB3O95704 486 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 APODP05090 189 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 IRF1P10914 325 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 VDRP11473 427 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 RARGP13631 454 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 GRIA2P42262 883 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PLA2G4AP47712 749 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PSEN1P49768 467 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SEC13P55735 322 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGAP8P85298 464 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXK2Q01167 660 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 NR1I3Q14994 352 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 STILQ15468 1287 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 CNGA2Q16280 664 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 FIGNQ5HY92 759 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 GJB7Q6PEY0 223 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 RRAGAQ7L523 313 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SCD5Q86SK9 330 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 LUZP1Q86V48 1076 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 KBTBD6Q86V97 674 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM25Q86YD3 366 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 STK32AQ8WU08 396 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 EBF1Q9UH73 591 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 NAGPAQ9UK23 515 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 MYO6Q9UM54 1294 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 USP18Q9UMW8 372 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 F8VZ95 297 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 MDM4O15151 490 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 TEX33O43247 280 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 TULP3O75386 442 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SETSIPP0DME0 302 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 RALAP11233 206 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SDHBP21912 280 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 CLCN1P35523 988 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 GPD2P43304 727 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 TNFRSF4P43489 277 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 DGKEP52429 567 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 BCAT1P54687 386 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 MFAP3P55082 362 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC8A3P57103 927 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 LMNB2Q03252 620 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 KDSRQ06136 332 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 PDE4CQ08493 712 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 LRMPQ12912 555 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 ARID5BQ14865 1188 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-210ENST00000588340 SYCP1Q15431 976 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms