RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MED15Q96RN5 788 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DCLK3Q9C098 648 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MIS12Q9H081 205 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EPC1Q9H2F5 836 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 THAP9Q9H5L6 903 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ST7Q9NRC1 585 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CEP250Q9BV73 2442 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 E7ENQ6 273 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 AXIN1O15169 862 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TULP3O75386 442 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STC2O76061 302 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH1A2O94788 518 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 APBB3O95704 486 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CYBBP04839 570 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TYRP14679 529 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GNA15P30679 374 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HOXA6P31267 233 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF4P43489 277 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MAN2A1Q16706 1144 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 VWA3BQ502W6 1294 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HS1BP3Q53T59 392 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 EOGTQ5NDL2 527 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 EMC10Q5UCC4 262 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SDE2Q6IQ49 451 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PMF1Q6P1K2 205 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DENND1CQ8IV53 801 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PGBD3Q8N328 593 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF276Q8N554 614 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ALLCQ8N6M5 410 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HSFY1Q96LI6 401 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 NDST4Q9H3R1 872 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PLK2Q9NYY3 685 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 USP18Q9UMW8 372 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ANTXRLA6NF34 631 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ18B7U540 433 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN9O14815 690 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GREM1O60565 184 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PON1P27169 355 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GBP1P32455 592 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ACADSBP45954 432 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DGKGP49619 791 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DAOAP59103 153 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 APBA1Q02410 837 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MESP2Q0VG99 397 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ12Q14500 433 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CRY1Q16526 586 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PKDCCQ504Y2 493 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ANO7Q6IWH7 933 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DDI1Q8WTU0 396 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PLD4Q96BZ4 506 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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