RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577435.5

GGA3-203, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-203ENST00000577435 CHKAP35790 457 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 GRIA2P42262 883 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 TNFRSF4P43489 277 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 TSSK4Q6SA08 328 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 C12orf40Q86WS4 652 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 CPXM2Q8N436 756 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 EDEM1Q92611 657 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 GOLGA1Q92805 767 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 GANQ9H2C0 597 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 FBXO10Q9UK96 956 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 R4GN57 208 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 LGALS16A8MUM7 142 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 PIK3R2O00459 728 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 CACNG3O60359 315 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 TULP3O75386 442 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 KAT7O95251 611 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 LATS1O95835 1130 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 APODP05090 189 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 KRT9P35527 623 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 PDCLQ13371 301 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 ANO4Q32M45 955 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 SYT13Q7L8C5 426 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 USP33Q8TEY7 942 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 MIS12Q9H081 205 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 DEC1Q9P2X7 70 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.58□□□□□ -0.07
GGA3-203ENST00000577435 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 PRR23AA6NEV1 266 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 SMTNL1A8MU46 457 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 E5RJQ4 531 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 IGLV3-27P01718 113 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 GLI1P08151 1106 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 HMBSP08397 361 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 TYRP14679 529 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 CYP11B1P15538 503 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 SNX16P57768 344 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 RING1Q06587 406 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 MESP2Q0VG99 397 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 DENND1CQ8IV53 801 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 NAT16Q8N8M0 369 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 AZIN2Q96A70 460 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 ACDQ96AP0 544 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 NOX5Q96PH1 765 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 CPXM1Q96SM3 734 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 BBS2Q9BXC9 721 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 ZNF292O60281 2723 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 FRYLO94915 3013 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 F8VZ95 297 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 GFRA2O00451 464 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 GFRA3O60609 400 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 CISD3P0C7P0 127 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 NCAM1P13591 858 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 CNR2P34972 360 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 JAM2P57087 298 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 ZNF445P59923 1031 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-203ENST00000577435 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms