RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCAR1P56945 870 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 TERF2Q15554 542 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTMPQ5BVD1 217 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRUNE1Q86TP1 453 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 NTAN1Q96AB6 310 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAM21Q9UKJ8 722 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 CAPN9O14815 690 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALDH2P05091 517 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 ETS1P14921 441 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEUP1Q05D60 604 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPS1Q13098 491 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.322e-6■■■□□ 18
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM131BQ86XD5 332 aa29.54■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CSPG4P5Q96PW8 444 aa29.53■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GOLGA6DP0CG33 693 aa29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM204AQ9H8W3 233 aa29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MARCH5Q9NX47 278 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHOC2Q9UQ13 582 aa29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RIPK2O43353 540 aa29.51■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 XRCC4Q13426 336 aa29.51■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM109Q9BVC6 243 aa29.51■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC29A2Q14542 456 aa29.5■■■□□ 2.31
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf228Q6PIY5 440 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa29.5■■■□□ 2.31
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXW11Q9UKB1 542 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 MICAL3Q7RTP6 2002 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.311e-8■■■■■ 60.3
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C8orf48Q96LL4 319 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGEB5Q9BZ81 275 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR62Q9BZJ7 368 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 PHACTR1Q9C0D0 580 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 GALTP07902 379 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4Q2P0C623 313 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRIK1P39086 918 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 NME3Q13232 169 aa29.48■■■□□ 2.31
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