RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTBN2	O15020	2390 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200		M0QYV0	167 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HMBS	P08397	361 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CISD3	P0C7P0	127 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HSFY1	Q96LI6	401 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	22.79	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC12A8	A0AV02	714 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	LCP1	P13796	627 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CHKA	P35790	457 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS7	P49802	495 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PLK5	Q496M5	336 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	EOGT	Q5NDL2	527 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FYB2	Q5VWT5	728 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ANO7	Q6IWH7	933 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND1C	Q8IV53	801 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	EDEM1	Q92611	657 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PLD4	Q96BZ4	506 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	USP18	Q9UMW8	372 aa		22.78	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRT4	C9JH25	899 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DCLK1	O15075	740 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A1	P19634	815 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	GPD2	P43304	727 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	LMNB2	Q03252	620 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CSRP2	Q16527	193 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	GJB7	Q6PEY0	223 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CPXM2	Q8N436	756 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	BHMT	Q93088	406 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PLK2	Q9NYY3	685 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		22.77	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3R2	O00459	728 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	EPN2	O95208	641 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	APBA1	Q02410	837 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MEA1	Q16626	185 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP9	Q9H5L6	903 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		22.76	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT5	P13647	590 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	DGKG	P49619	791 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP8	P85298	464 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GBP6	Q6ZN66	633 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF139	Q8WU17	664 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	22.75	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	BECN2	A8MW95	431 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GFRA2	O00451	464 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PON1	P27169	355 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MFAP3	P55082	362 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM81B	Q96LP2	452 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CD248	Q9HCU0	757 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ACP6	Q9NPH0	428 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH1A2	O94788	518 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO21	O94952	628 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FYN	P06241	537 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		22.74	■■□□□ 1.23

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