RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	BRD9	Q9H8M2	597 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GGA3	Q9NZ52	723 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	PASK	Q96RG2	1323 aa		3.16	□□□□□ -1.9
AKAP13-223	ENST00000560957	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TARM1	B6A8C7	271 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ACKR2	O00590	384 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TIPRL	O75663	272 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM155B	O75949	473 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SGPL1	O95470	568 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX18	O95935	607 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBB4A	P04350	444 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ALOX12	P18054	663 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATIC	P31939	592 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT20	P35900	424 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LIFR	P42702	1097 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA8	P53708	1063 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	POLE2	P56282	527 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NXPH1	P58417	271 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FMO1	Q01740	532 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ITIH3	Q06033	890 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TCF15	Q12870	199 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPC3	Q13507	836 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PMS2P11	Q13670	270 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CNGA2	Q16280	664 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZTC4	211 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BEND5	Q7L4P6	421 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC7B	Q86TV6	843 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FANCB	Q8NB91	859 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	IL31RA	Q8NI17	732 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP2A3	Q93084	1043 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAMP4	Q969E2	229 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RFK	Q969G6	155 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HVCN1	Q96D96	273 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PBK	Q96KB5	322 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TIGD1	Q96MW7	591 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR35	Q9HC97	309 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SERHL	Q9NQF3	203 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KLC4	Q9NSK0	619 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RLIM	Q9NVW2	624 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0B4J269	797 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCA1	A8K7I4	914 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TISP43	B9A030	160 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		B9A039	149 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		H7C0S8	307 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	POLB	P06746	335 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA5	P08648	1049 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3CA	P42336	1068 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP2K6	P52564	334 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HK3	P52790	923 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NR1H2	P55055	460 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PLIN5	Q00G26	463 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBB3	Q13509	450 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PROSER3	Q2NL68	480 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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