RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 COPAP53621 1224 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 RIPPLY3P57055 190 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ASIC1P78348 528 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF234Q14588 700 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 FAM171BQ6P995 826 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 USP53Q70EK8 1073 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 OSTM1Q86WC4 334 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 NUP93Q8N1F7 819 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 EXD3Q8N9H8 876 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SLC6A18Q96N87 628 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ABCG4Q9H172 646 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SGK2Q9HBY8 427 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 PLK2Q9NYY3 685 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 KCND2Q9NZV8 630 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SCN1AP35498 2009 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MYOFQ9NZM1 2061 aa10.24□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MGAQ8IWI9 3026 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MYLKQ15746 1914 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 GABRDO14764 452 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 HCRTO43612 131 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CSO75390 466 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 FAM13AO94988 1023 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 PDGFRBP09619 1106 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM191BP0C7N4 346 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 PLCG1P19174 1290 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CD38P28907 300 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 TUBP50607 506 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 RBP5P82980 135 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 C3orf38Q5JPI3 329 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 KIAA0895LQ68EN5 471 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 HTR3DQ70Z44 454 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 DPH6Q7L8W6 267 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 FAM26EQ8N5C1 309 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MYCT1Q8N699 235 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 RDH13Q8NBN7 331 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 GTF3C6Q969F1 213 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 HPS3Q969F9 1004 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 PCED1BQ96HM7 432 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 FBRSQ9HAH7 460 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 PDRG1Q9NUG6 133 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.23□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PPC4 97 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 BLACEA4D250 179 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 DTNBO60941 627 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 GJB6O95452 261 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CYBBP04839 570 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ITGB2P05107 769 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CISD3P0C7P0 127 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 PRKCHP24723 683 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ZBTB16Q05516 673 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ENPP2Q13822 863 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 TTC38Q5R3I4 469 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 POMGNT1Q8WZA1 660 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 EXTL1Q92935 676 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SNX25Q9H3E2 840 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ODF2LQ9ULJ1 636 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ATP8B3O60423 1300 aa10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 LRRC72A6NJI9 287 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 CYP26A1O43174 497 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 TLR5O60602 858 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 REC8O95072 547 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 FAM87AP0C7U9 286 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ACO1P21399 889 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 MFAP3P55082 362 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 BNIP3Q12983 259 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 POSTNQ15063 836 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 SHBQ15464 509 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 GEN1Q17RS7 908 aa10.21□□□□□ -0.77
SMAD3-211ENST00000559460 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms