RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRADDP78560 199 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 STILQ15468 1287 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX27Q96L92 541 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 KATNBL1Q9H079 304 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLK14Q9P0G3 267 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARMCX1Q9P291 453 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT37O76014 449 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RASSF2P50749 326 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB16Q05516 673 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS52Q8N1B4 723 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SKA1Q96BD8 255 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 OSMRQ99650 979 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP41Q9BYV8 373 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF181Q9P0P0 153 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLLPQ9Y342 182 aa20.69■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 A6NJR5 290 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 WFS1O76024 890 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOT1P17174 413 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMPD1P17405 629 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK16Q00536 496 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 DPYSL2Q16555 572 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC39CQ8N584 583 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPTLC1O15269 473 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADCY6O43306 1168 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGEA3P43357 314 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGEA6P43360 314 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB6Q15916 424 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM131BQ86XD5 332 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP6NLQ92738 828 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 LGMNQ99538 433 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAR1AQ9NR31 198 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 DTLQ9NZJ0 730 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.68■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 KITP10721 976 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 VAV1P15498 845 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 BST1Q10588 318 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 VTA1Q9NP79 307 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL1A2P08123 1366 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RECQL4O94761 1208 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 IRX4P78413 519 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAA25Q14CX7 972 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPAINQ86UA6 219 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 COX16Q9P0S2 106 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.67■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 GCATO75600 419 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 MMP3P08254 477 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPBGLP0DKB5 382 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SETSIPP0DME0 302 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNAZP19086 355 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMPRSS15P98073 1019 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 TGDSO95455 350 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CALB2P22676 271 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CPA2P48052 419 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHI3L2Q15782 390 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 RINLQ6ZS11 566 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.66■□□□□ 0.9
AFG3L1P-217ENST00000557444 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms