RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 IGLV3-25P01717 112 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PSMC3P17980 439 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 FLT3P36888 993 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PTPN9P43378 593 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 GALCP54803 685 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 FCHO2Q0JRZ9 810 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 MAMLD1Q13495 774 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SYPL2Q5VXT5 272 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 NUGGCQ68CJ6 796 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC8AQ8IWT6 810 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SH3RF2Q8TEC5 729 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 FNIP1Q8TF40 1166 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 NT5C3BQ969T7 300 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 MCEEQ96PE7 176 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 THAP2Q9H0W7 228 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 KCNK12Q9HB15 430 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF510Q9Y2H8 683 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 FAM170AA1A519 330 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 LEFTY2O00292 366 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 IRAK2O43187 625 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CYP1A2P05177 515 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SLC2A3P11169 496 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 KRT83P78385 493 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 MTF1Q14872 753 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TANGO2Q6ICL3 276 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 YAF2Q8IY57 180 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 OTUB2Q96DC9 234 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 NPY6RQ99463 290 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 FAM204AQ9H8W3 233 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SMPD4Q9NXE4 827 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D14Q9P2M4 693 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 UVRAGQ9P2Y5 699 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 LIMD1Q9UGP4 676 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CCL26Q9Y258 94 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SLC12A8A0AV02 714 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 C2CD4BA6NLJ0 364 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 LATS1O95835 1130 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PDGFRAP16234 1089 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 GPD1P21695 349 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SULT1E1P49888 294 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 VITQ6UXI7 678 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TAC4Q86UU9 113 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 UNC45BQ8IWX7 931 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 RHOT2Q8IXI1 618 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 NCAPGQ9BPX3 1015 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 KXD1Q9BQD3 176 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 MDM4O15151 490 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 IGLV3-27P01718 113 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 VIPR2P41587 438 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 HARS2P49590 506 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TBX4P57082 545 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 STRADAQ7RTN6 431 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 DDIT4Q9NX09 232 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CFAP97Q9P2B7 532 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 MYO1AQ9UBC5 1043 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 COL4A2P08572 1712 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 M0QYT0 321 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF263O14978 683 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CHADO15335 359 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 STC2O76061 302 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 APOEP02649 317 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 MAGEA1P43355 309 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 RAD9BQ6WBX8 426 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 HTR3DQ70Z44 454 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 GJD3Q8N144 294 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 EMC1Q8N766 993 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 JOSD2Q8TAC2 188 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 RXFP2Q8WXD0 754 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CNPY3Q9BT09 278 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 SORCS3Q9UPU3 1222 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 CCR1P32246 355 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 TDGQ13569 410 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PPP2R5DQ14738 602 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ACAP1Q15027 740 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PDGFRLQ15198 375 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 BNIPLQ7Z465 357 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRK-218ENST00000525459 RFFLQ8WZ73 363 aa19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms