RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344		E5RJQ4	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PPEF2	O14830	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CAND2	O75155	1236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MST1	P26927	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PTGER1	P34995	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PLCD1	P51178	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	KCNQ3	O43525	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PRC1	O43663	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MOSPD3	O75425	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GABRB3	P28472	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GSTM5	P46439	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	VPS41	P49754	854 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	NEK3	P51956	506 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	WDR24	Q96S15	920 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RASA4B	C9J798	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PODXL	O00592	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RASA4	O43374	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	BMP15	O95972	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	VIP	P01282	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MYL1	P05976	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	EGR1	P18146	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PICALM	Q13492	652 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CNGA3	Q16281	694 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	INPPL1	O15357	1258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FGF18	O76093	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	FGB	P02675	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ALAD	P13716	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC5A2	P31639	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	AK2	P54819	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ID2	Q02363	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	STIM1	Q13586	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ELF2	Q15723	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PIGK	Q92643	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPEB4-210	ENST00000522344	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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