RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	INPPL1	O15357	1258 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	SNHG28	P0DPA3	235 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	JAK3	P52333	1124 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RNF44	Q7L0R7	432 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PHKB	Q93100	1093 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PLAU	P00749	431 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	FGF2	P09038	288 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PSG1	P11464	419 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	TNFRSF1B	P20333	461 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	YY1	P25490	414 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PBX1	P40424	430 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	MTX1	Q13505	466 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	STIM1	Q13586	685 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	DAG1	Q14118	895 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	KCNJ12	Q14500	433 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	P3H2	Q8IVL5	708 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	TIFA	Q96CG3	184 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	P2RY11	Q96G91	374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CLCA1	A8K7I4	914 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	IL18RAP	O95256	599 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ATIC	P31939	592 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	IDUA	P35475	653 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ME1	P48163	572 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	TRMO	Q9BU70	441 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	POT1	Q9NUX5	634 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CD8B2	A6NJW9	211 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	OAZ2	O95190	189 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CCKBR	P32239	447 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	WASF1	Q92558	559 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	IQCD	Q96DY2	449 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PRY	O14603	147 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	THAP12	O43422	761 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	KCNQ3	O43525	872 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	SCP2	P22307	547 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RPS6KB1	P23443	525 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	MST1	P26927	711 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CCKAR	P32238	428 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CPA2	P48052	419 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	DGKQ	P52824	942 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	B4GALNT1	Q00973	533 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	GAB1	Q13480	694 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS5-208	ENST00000519057	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS5-208	ENST00000519057		H3BNX3	289 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS5-208	ENST00000519057	AREL1	O15033	823 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS5-208	ENST00000519057	TSHR	P16473	764 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS5-208	ENST00000519057	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS5-208	ENST00000519057	GPS1	Q13098	491 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL22	Q53GT1	634 aa		5.15	□□□□□ -1.59

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