RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 HSFY1Q96LI6 401 aa17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PAFAH2Q99487 392 aa17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 FKTNO75072 461 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CNGA2Q16280 664 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 HTR3CQ8WXA8 447 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 COPS5Q92905 334 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PRR23AA6NEV1 266 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.467e-20■■■■■ 123.4
PTDSS1-202ENST00000517309 GRK2P25098 689 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 NPY2RP49146 381 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC149Q6ZUS6 474 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF333Q96JL9 665 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 EFCAB14O75071 495 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ENDOD1O94919 500 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 DSG4Q86SJ6 1040 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF558Q96NG5 402 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PGLYRP2Q96PD5 576 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 C2CD2Q9Y426 696 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 RAD54BQ9Y620 910 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 SCUBE3Q8IX30 993 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 DACH2Q96NX9 599 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 APOL2Q9BQE5 337 aa17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 C3P01024 1663 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 GRK3P35626 688 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 NSL1Q96IY1 281 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 SLIT3O75094 1523 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PJA2O43164 708 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 AKAP10O43572 662 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 NOS2P35228 1153 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PRKCIP41743 596 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PRKCQQ04759 706 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM199Q8N511 208 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 LENG9Q96B70 501 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 TUBGCP3Q96CW5 907 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 MTMR8Q96EF0 704 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 GPAMQ9HCL2 828 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 OCM2P0CE71 109 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ACADMP11310 421 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 SCNN1GP51170 649 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CBWD6Q4V339 395 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 KDM7AQ6ZMT4 941 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 LONP2Q86WA8 852 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 STX19Q8N4C7 294 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM162AQ96A26 154 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 DYRK1BQ9Y463 629 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 C16orf96A6NNT2 1141 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 LYPLA2O95372 231 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 IRAK1P51617 712 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAJC3Q13217 504 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PTF1AQ7RTS3 328 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 IL17RAQ96F46 866 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 OLFM3Q96PB7 478 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 THTPAQ9BU02 230 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 IGSF6O95976 241 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 RPL9P32969 192 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CNGA3Q16281 694 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 C17orf80Q9BSJ5 609 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 GGT7Q9UJ14 662 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 BLOC1S6Q9UL45 172 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CDH9Q9ULB4 789 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 BDNFP23560 247 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 MEA1Q16626 185 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 KLC4Q9NSK0 619 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 PSEN1P49768 467 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM110CQ1W6H9 321 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 WDR59Q6PJI9 974 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 FOXR2Q6PJQ5 311 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 RFX8Q6ZV50 586 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 ULBP1Q9BZM6 244 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 WDR41Q9HAD4 459 aa17.92■□□□□ 0.46
PTDSS1-202ENST00000517309 USP20Q9Y2K6 914 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms