RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 FITM2Q8N6M3 262 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 MAML1Q92585 1016 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ITPKCQ96DU7 683 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NUP85Q9BW27 656 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 DCLK3Q9C098 648 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CLMPQ9H6B4 373 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SAR1AQ9NR31 198 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 RGL1Q9NZL6 768 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.54□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FAM170BA6NMN3 283 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GAS7O60861 476 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 HIP1RO75146 1068 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ATP2C2O75185 946 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ASMTLO95671 621 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 IL1BP01584 269 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CAPNS1P04632 268 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KRT16P08779 473 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 POLR2MP0CAP2 368 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 PLS3P13797 630 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CYP11B1P15538 503 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 GNAZP19086 355 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CALB2P22676 271 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ALDH3A1P30838 453 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 STX2P32856 288 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 PTPN7P35236 360 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 MXI1P50539 228 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CYP2J2P51589 502 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NCKAP1LP55160 1127 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 BPIFB4P59827 614 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CYP4A11Q02928 519 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SETDB1Q15047 1291 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KRT39Q6A163 491 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CGB2Q6NT52 195 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SERINC5Q86VE9 423 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TPH2Q8IWU9 490 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF843Q8N446 348 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 HELQQ8TDG4 1101 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 APBB2Q92870 758 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF653Q96CK0 615 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF570Q96NI8 536 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.53□□□□□ -1.2
SMIM20-202ENST00000514384 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 THAP12O43422 761 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 FAM155BO75949 473 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 PROSCO94903 275 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 KLRC2P26717 231 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ADSSP30520 456 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 CA8P35219 290 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 IFNAR2P48551 515 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ITGA8P53708 1063 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 STARD6P59095 220 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 UBE3AQ05086 875 aa7.52□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MPP2Q14168 576 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms