RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RCE1Q9Y256 329 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SEPT4O43236 478 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFA10O95299 355 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ALADP13716 330 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 BMP7P18075 431 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCD3P28288 659 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA1Q5VX52 437 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PDILTQ8N807 584 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 NPIPB3Q92617 1050 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TOX2Q96NM4 488 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAM2Q99965 735 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB21Q9UL25 225 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 A8MVJ9 347 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 K7ENM7 598 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMD9O00233 223 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM20BO75063 409 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 GFPT2O94808 682 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RHOP08100 348 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CSF1P09603 554 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CFPP27918 469 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PGM1P36871 562 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 LIPAP38571 399 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CLCN2P51788 898 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 BAK1Q16611 211 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 C1QL4Q86Z23 238 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 P3H2Q8IVL5 708 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 EDAQ92838 391 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 AGAP5A6NIR3 686 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SPRY2O43597 315 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FESP07332 822 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ITIH3Q06033 890 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR68Q15743 365 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HS1BP3Q53T59 392 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf89Q6UX73 402 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SSH3Q8TE77 659 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP10Q96AY3 582 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 FAR2Q96K12 515 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PIGSQ96S52 555 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ADOQ96SZ5 270 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PEX12O00623 359 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SPTLC2O15270 562 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 NKX2-8O15522 239 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM63AO94886 807 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PEPDP12955 493 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MCM5P33992 734 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ICAM4Q14773 271 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TREML2Q5T2D2 321 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS50Q96JG6 964 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 IL21RQ9HBE5 538 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms