RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 DPP6P42658 865 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 COG7P83436 770 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PNOCQ13519 176 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SLC23A3Q6PIS1 610 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 SLC36A4Q6YBV0 504 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PIGZQ86VD9 579 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 FAXDC2Q96IV6 333 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 FBXO10Q9UK96 956 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.77■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 WASH3PC4AMC7 463 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 STX10O60499 249 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ZNF217O75362 1048 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CFIP05156 583 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CEACAM1P13688 526 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ENGP17813 658 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ZNF33AQ06730 810 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP17Q68EM7 881 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 UBXN6Q9BZV1 441 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A17Q9H1V8 727 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 FSCN3Q9NQT6 498 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.76■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CHD8Q9HCK8 2581 aa17.75■□□□□ 0.43
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HERC3-211ENST00000513325 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 HOXD12P35452 270 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CHKAP35790 457 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PRCPP42785 496 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 DUOXA1Q1HG43 343 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CBWD6Q4V339 395 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 RAB41Q5JT25 222 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 TCERG1LQ5VWI1 586 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 FYB2Q5VWT5 728 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 DENND1CQ8IV53 801 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD52Q8NB46 1076 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 DEFB124Q8NES8 71 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CCDC34Q96HJ3 373 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 DCLK3Q9C098 648 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CD93Q9NPY3 652 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 MARCH2Q9P0N8 246 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A14Q9UN76 642 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa17.75■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 GFRA2O00451 464 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 TKTL1P51854 596 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 MFAP3P55082 362 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC8A3P57103 927 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 FOXC1Q12948 553 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CEP76Q8TAP6 659 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 RMND1Q9NWS8 449 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 STON1Q9Y6Q2 735 aa17.74■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A8A0AV02 714 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 TULP2O00295 520 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 GEN1Q17RS7 908 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 TRIML1Q8N9V2 468 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 HSPA12BQ96MM6 686 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 TSG101Q99816 390 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ULBP1Q9BZM6 244 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CAPN10Q9HC96 672 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN16Q9UKR8 245 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 STRIP2Q9ULQ0 834 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 COQ4Q9Y3A0 265 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 GON4LQ3T8J9 2241 aa17.73■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CEP192Q8TEP8 1941 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 NDUFS2O75306 463 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ZBED1O96006 694 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SERPINF2P08697 491 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SPINK2P20155 84 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PMS1P54277 932 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PDE4CQ08493 712 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CUL2Q13617 745 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 STARD3Q14849 445 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD40Q6AI12 368 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC32A1Q9H598 525 aa17.72■□□□□ 0.43
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