RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512107.5

MATR3-238, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM253	P0C7T8	217 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	IRF1	P10914	325 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KRT3	P12035	628 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TCF4	P15884	667 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MATK	P42679	507 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PSEN1	P49768	467 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GPC5	P78333	572 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	USP4	Q13107	963 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF77	Q15935	545 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	IER5L	Q5T953	404 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	BEND5	Q7L4P6	421 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SMARCD2	Q92925	531 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NUP85	Q9BW27	656 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02	7e-25	■□□□□ 8.5
MATR3-238	ENST00000512107	GDE1	Q9NZC3	331 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MYO10	Q9HD67	2058 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	COL4A2	P08572	1712 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DPYSL4	O14531	572 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	STC2	O76061	302 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	IGLV3-27	P01718	113 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CKM	P06732	381 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RALA	P11233	206 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02	3e-13	■□□□□ 10.8
MATR3-238	ENST00000512107	WEE1	P30291	646 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NOS2	P35228	1153 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ATP11A	P98196	1134 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GRM2	Q14416	872 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLC39A13	Q96H72	371 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PIGV	Q9NUD9	493 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TDP1	Q9NUW8	608 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02	6e-12	■□□□□ 10.5
MATR3-238	ENST00000512107	COX16	Q9P0S2	106 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	UST	Q9Y2C2	406 aa		15.18	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	IRAK2	O43187	625 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PDGFRA	P16234	1089 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GPD1	P21695	349 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARHGAP25	P42331	645 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SULT1E1	P49888	294 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	HDAC4	P56524	1084 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ARC	Q7LC44	396 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TTC16	Q8NEE8	873 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PEBP4	Q96S96	227 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PARVA	Q9NVD7	372 aa		15.17	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SOBP	A7XYQ1	873 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107		M0QYT0	321 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CAPN9	O14815	690 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	PJA2	O43164	708 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	ENDOD1	O94919	500 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	MYBL1	P10243	752 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	AVPR1A	P37288	418 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	NME3	Q13232	169 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	CDO1	Q16878	200 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	AAK1	Q2M2I8	961 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		15.16	■□□□□ 0.02
MATR3-238	ENST00000512107	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		15.16	■□□□□ 0.02

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