RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SCD5Q86SK9 330 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ACOX2Q99424 681 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 PLK2Q9NYY3 685 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PQF6 199 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 PRRT4C9JH25 899 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 GIPC1O14908 333 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 NPC1O15118 1278 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 HMBSP08397 361 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CISD3P0C7P0 127 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 STARD3Q14849 445 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 Q6ZNB5 142 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 SEMA4DQ92854 862 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 GABRG3Q99928 467 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD23BP54727 409 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXC1Q12948 553 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 PIGZQ86VD9 579 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 HESX1Q9UBX0 185 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 HCN2Q9UL51 889 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC12A8A0AV02 714 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SERPINF2P08697 491 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFV2P19404 249 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 TKTL1P51854 596 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF132P52740 706 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 ARID5AQ03989 594 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 DENND1CQ8IV53 801 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB124Q8NES8 71 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXJ1Q92949 421 aa20.2■□□□□ 0.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD54BQ9Y620 910 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SMC2O95347 1197 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBED1O96006 694 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 KLKB1P03952 638 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SYPP08247 313 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 PNOCQ13519 176 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SGO2Q562F6 1265 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 DDI1Q8WTU0 396 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF139Q8WU17 664 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 GSDMAQ96QA5 445 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 WASH3PC4AMC7 463 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 OPHN1O60890 802 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 CD19P15391 556 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 GNSP15586 552 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 PRCPP42785 496 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB41Q5JT25 222 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 FYB2Q5VWT5 728 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 PLD4Q96BZ4 506 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 TIMM44O43615 452 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 BCAT1P54687 386 aa20.17■□□□□ 0.82
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