RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 FAXCQ5TGI0 409 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 AWAT2Q6E213 333 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC150Q8NCX0 1101 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.86□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 RRHO14718 337 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KCNQ3O43525 872 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TLR2O60603 784 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CBFA2T3O75081 653 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CTSAP10619 480 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MYL4P12829 197 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 THBS4P35443 961 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 STT3AP46977 705 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 STIM1Q13586 685 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 BEND5Q7L4P6 421 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 WDR24Q96S15 920 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TBCBQ99426 244 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SARGQ9BW04 601 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 A0A1W2PPC4 97 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 APOL1O14791 398 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 INPPL1O15357 1258 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 DRD1P21728 446 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 MST1P26927 711 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 HSF1Q00613 529 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 DEF8Q6ZN54 512 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 TM2D2Q9BX73 214 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-203ENST00000503080 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 APAF1O14727 1248 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ITGB6P18564 788 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 BFSP2Q13515 415 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 CNGA3Q16281 694 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.83□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 C8orf48Q96LL4 319 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 FCRL5Q96RD9 977 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 HEY2Q9UBP5 337 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.83□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PROB1E7EW31 1015 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PMM2O15305 246 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 NTN1O95631 604 aa4.82□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 PLAUP00749 431 aa4.82□□□□□ -1.64
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UBE2B-203ENST00000503080 IDEP14735 1019 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 DUSP1P28562 367 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 SLC5A2P31639 672 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 CPA2P48052 419 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MAPK7Q13164 816 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PIP4P1Q86T03 277 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 PIGKQ92643 395 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.82□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 MYMKA6NI61 221 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-203ENST00000503080 TTC34A8MYJ7 566 aa4.81□□□□□ -1.64
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