RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498713.1

ANKRD28-214, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 1,091 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-214ENST00000498713 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ZNF606Q8WXB4 792 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 MMS19Q96T76 1030 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ISCUQ9H1K1 167 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 DEF6Q9H4E7 631 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 SNX9Q9Y5X1 595 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PODXLO00592 558 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TACC1O75410 805 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GZMAP12544 262 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 P4HA1P13674 534 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 RAG1P15918 1043 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 LMO2P25791 158 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PNPLA4P41247 253 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TAF6P49848 677 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GATMP50440 423 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 VAV2P52735 878 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 NDST1P52848 882 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GALCP54803 685 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TNNC1P63316 161 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GRIK3Q13003 919 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TUSC3Q13454 348 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 SV2CQ496J9 727 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ZNF394Q53GI3 561 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TAF3Q5VWG9 929 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 DPH6Q7L8W6 267 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 STK32AQ8WU08 396 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 SENP8Q96LD8 212 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TWNKQ96RR1 684 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 INTUQ9ULD6 942 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PTPRDP23468 1912 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TSC2P49815 1807 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 COL4A6Q14031 1691 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 F8W810 466 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CYB561D2O14569 222 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GABRDO14764 452 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CCP110O43303 1012 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 HCRTO43612 131 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 RTN2O75298 545 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 DGKIO75912 1065 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ITGB1P05556 798 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PAEPP09466 180 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PDGFRBP09619 1106 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ACRP10323 421 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 GNA15P30679 374 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 BRCC3P46736 316 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 HMGA2P52926 109 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ORC1Q13415 861 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PTPN14Q15678 1187 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CNGA2Q16280 664 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 WSCD1Q658N2 575 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 KIAA1328Q86T90 577 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ACOT1Q86TX2 421 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 PDZD3Q86UT5 571 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 VPS36Q86VN1 386 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 OSTM1Q86WC4 334 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-214ENST00000498713 ZNF677Q86XU0 584 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms