RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	BAP1	Q92560	729 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	BHMT	Q93088	406 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	C18orf8	Q96DM3	657 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NELL2	Q99435	816 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	COX16	Q9P0S2	106 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CACNA1H	O95180	2353 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NCAM2	O15394	837 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ADH1C	P00326	375 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TPM3	P06753	285 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TNFAIP3	P21580	790 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PBX1	P40424	430 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SLC6A11	P48066	632 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TBX4	P57082	545 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	AMPD2	Q01433	879 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	KDSR	Q06136	332 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TAC4	Q86UU9	113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DEFB106A	Q8N104	65 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CD101	Q93033	1021 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PLD4	Q96BZ4	506 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	OTUB2	Q96DC9	234 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MSANTD3	Q96H12	275 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	AGPAT1	Q99943	283 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DCLK3	Q9C098	648 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	PLK2	Q9NYY3	685 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CBFA2T2	O43439	604 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TSPAN3	O60637	253 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	EGF	P01133	1207 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CHRNB1	P11230	501 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SKIL	P12757	684 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	OPRD1	P41143	372 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GAD2	Q05329	585 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FZD5	Q13467	585 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GAB4	Q2WGN9	574 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024		Q6ZNB5	142 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	C12orf40	Q86WS4	652 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	BBS2	Q9BXC9	721 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	MYO6	Q9UM54	1294 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM24	O15164	1050 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	HSF2BP	O75031	334 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	DAB1	O75553	588 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GJB6	O95452	261 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	GLI1	P08151	1106 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	TYR	P14679	529 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CALD1-223	ENST00000496024	CHKA	P35790	457 aa		10.23	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms