RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP29Q9HBJ7 922 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FCHO1O14526 889 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FYB1O15117 783 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHHO43323 396 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCAR3O75815 825 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DGKQP52824 942 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RANBP10Q6VN20 620 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYD88Q99836 296 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHST12Q9NRB3 414 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.33□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TP73O15350 636 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IDEP14735 1019 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNSP34059 522 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSPA7P48741 367 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC14A1Q13336 389 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPEG1Q2M385 716 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MORN5Q5VZ52 161 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VSTM1Q6UX27 236 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 P3H2Q8IVL5 708 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF566Q969W8 418 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1191Q96A73 305 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SGCZQ96LD1 299 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.32□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IKBKBO14920 756 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLA2G6O60733 806 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP25P42331 645 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRLQ86TD4 932 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SVIPQ8NHG7 77 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEPTORQ8TB45 409 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP4K1Q92918 833 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIC2Q96JB3 615 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CERS4Q9HA82 394 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NECTIN3Q9NQS3 549 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.31□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DRD1P21728 446 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB9Q96C00 473 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C18orf8Q96DM3 657 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.3□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E5RJQ4 531 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PODXLO00592 558 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VIPP01282 170 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JAK3P52333 1124 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB30Q15771 203 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNGA4Q8IV77 575 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GJA10Q969M2 543 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNIP3Q96KP6 325 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK33Q9BYT3 514 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.29□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.28□□□□□ -1.56
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0QZQ0 153 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms