RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 TUBA1BP68363 451 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 DAAM2Q86T65 1068 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 OSTM1Q86WC4 334 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 CASP10Q92851 521 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC45Q96CN5 670 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 DRC3Q9H069 523 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 CDH9Q9ULB4 789 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 NME7Q9Y5B8 376 aa7.52□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 CFHP08603 1231 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PRLRP16471 622 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 BCAT1P54687 386 aa7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PASD1Q8IV76 773 aa7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 OLFM3Q96PB7 478 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 CENPKQ9BS16 269 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.51□□□□□ -1.21
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