RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 CSRP2Q16527 193 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 EMC10Q5UCC4 262 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 PMF1Q6P1K2 205 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 GBP6Q6ZN66 633 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 SFTPA1Q8IWL2 248 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 CPXM2Q8N436 756 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 RMDN1Q96DB5 314 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 MED15Q96RN5 788 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 THAP9Q9H5L6 903 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 DLL3Q9NYJ7 618 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO10Q9UK96 956 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-211ENST00000492545 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 E7ENQ6 273 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 MED7O43513 233 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 RHOBTB1O94844 696 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT5P13647 590 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 DAOAP59103 153 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 KBTBD6Q86V97 674 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA1Q92805 767 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 PARD6AQ9NPB6 346 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SEMA4GQ9NTN9 838 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SGK1O00141 431 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 CYBBP04839 570 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 HMBSP08397 361 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 LCP1P13796 627 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 DGKGP49619 791 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF445P59923 1031 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 E2F5Q15329 346 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ELF2Q15723 593 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ANO7Q6IWH7 933 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM65Q6PJ69 517 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM92Q6UXU6 159 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 DENND1CQ8IV53 801 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 STK32AQ8WU08 396 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SDK1Q7Z5N4 2213 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 EPN2O95208 641 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 LATS1O95835 1130 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 CISD3P0C7P0 127 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 PLK5Q496M5 336 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SDE2Q6IQ49 451 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ANTXRLA6NF34 631 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAM23O75077 832 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 NTSR1P30989 418 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ACADSBP45954 432 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 RGS7P49802 495 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 FYB2Q5VWT5 728 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SPAG17Q6Q759 2223 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 NPC1O15118 1278 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 GPD2P43304 727 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 MAN2A1Q16706 1144 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 EDEM1Q92611 657 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 GFRA2O00451 464 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM24O15164 1050 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 GABBR2O75899 941 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 LTFP02788 710 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC9A1P19634 815 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-211ENST00000492545 PRR23CQ6ZRP0 262 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms