RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	VDR	P11473	427 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2C9	P11712	490 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	RRM1	P23921	792 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRNA3	P32297	505 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	GBP1	P32455	592 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	GIPR	P48546	466 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	FNTA	P49354	379 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	RWDD2B	P57060	319 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX17	Q15036	470 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	STIL	Q15468	1287 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CNGA2	Q16280	664 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	DUPD1	Q68J44	220 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	UNC93A	Q86WB7	457 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	PRELID2	Q8N945	189 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	TFAP2B	Q92481	460 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CPB2	Q96IY4	423 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT12	Q99456	494 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC19	Q9H756	370 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MED4	Q9NPJ6	270 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247		O00370	1275 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	PIR	O00625	290 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SPOP	O43791	374 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJA2	O60884	412 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS4	O75173	837 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ATE1	O95260	518 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CD4	P01730	458 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGB3	P05106	788 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	PYGM	P11217	842 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGA4	P13612	1032 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	FOSL1	P15407	271 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2B6	P20813	491 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	LRPAP1	P30533	357 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	PNPLA4	P41247	253 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCKSL1	P49006	195 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MGAT3	Q09327	533 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO1E	Q12965	1108 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	GPS2	Q13227	327 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	NOG	Q13253	232 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MESD	Q14696	234 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ACAP1	Q15027	740 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	TAZ	Q16635	292 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ALS2CL	Q60I27	953 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ARC	Q7LC44	396 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	SERINC5	Q86VE9	423 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	HID1	Q8IV36	788 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCK	Q8N0W5	287 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATG4A-208	ENST00000489247	BEST2	Q8NFU1	509 aa		5.84	□□□□□ -1.47

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