RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488612.5

RAD51B-212, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-212ENST00000488612 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 ARCQ7LC44 396 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 MIB1Q86YT6 1006 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 FGF13Q92913 245 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 PEBP4Q96S96 227 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 MYADMQ96S97 322 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 PIGVQ9NUD9 493 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 EHD2Q9NZN4 543 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 MUC3AQ02505 3323 aa8.4□□□□□ -1.06
RAD51B-212ENST00000488612 M0QYT0 321 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 FANCGO15287 622 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 IRAK2O43187 625 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 MBTPS2O43462 519 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 GREM1O60565 184 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 LRCH4O75427 683 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 RALAP11233 206 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 HDCP19113 662 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 FSHRP23945 695 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 PSMA2P25787 234 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 IL1R2P27930 398 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 SDC4P31431 198 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 PTPN9P43378 593 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 PSEN1P49768 467 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 KCNQ1P51787 676 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 TAS2R40P59535 323 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 KIF5AQ12840 1032 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 NME3Q13232 169 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 HS1BP3Q53T59 392 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 CES5AQ6NT32 575 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 BEND5Q7L4P6 421 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF276Q8N554 614 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 CCDC185Q8N715 623 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 GOLGA1Q92805 767 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 HLA-CQ95604 372 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 DDIT4Q9NX09 232 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 USTQ9Y2C2 406 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 CPQQ9Y646 472 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 NUP205Q92621 2012 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 SLC12A8A0AV02 714 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 MYO1FO00160 1098 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 KRT86O43790 486 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 PALMO75781 387 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 PROSCO94903 275 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ENDOD1O94919 500 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 KLKB1P03952 638 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 IRF1P10914 325 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 COMTP21964 271 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 FCARP24071 287 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 GGCXP38435 758 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 VIPR2P41587 438 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 PPP3CCP48454 512 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 TUBP50607 506 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ARTNQ5T4W7 220 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 FAM131BQ86XD5 332 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 LEMD2Q8NC56 503 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 TTC16Q8NEE8 873 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 RNF139Q8WU17 664 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD51B-212ENST00000488612 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms