RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR39	O43194	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	TEX33	O43247	280 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	BCAR3	O75815	825 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	GH2	P01242	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOXC6	P09630	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNA2	P16389	499 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRIA3	P42263	894 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF81	P51508	661 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC5A3	P53794	718 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCL14	Q16627	93 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	PORCN	Q9H237	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	RLF	Q13129	1914 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	COL6A3	P12111	3177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYH8	P13535	1937 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	LINC00473	A8K010	186 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	STRN	O43815	780 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CNMD	O75829	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	EDNRB	P24530	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	WAS	P42768	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941		Q7L0L9	218 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	LPAR1	Q92633	364 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	NCOR1	O75376	2440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941		E9PLN8	166 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941		K7ESF4	209 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	DNM1L	O00429	736 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	HAUS5	O94927	633 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHRM2	P08172	466 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPP3CB	P16298	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	VCAM1	P19320	739 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SHMT1	P34896	483 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	PLCD1	P51178	756 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	GABPA	Q06546	454 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRB14	Q14449	540 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	COG2	Q14746	738 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTPRR	Q15256	657 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SNRNP40-205	ENST00000486941	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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