RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 COL6A3P12111 3177 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PATJQ8NI35 1801 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 MACROD2A1Z1Q3 448 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 COCHO43405 550 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 MTA2O94776 668 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 LATS1O95835 1130 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 OAS1P00973 400 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 CYBBP04839 570 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 MAN1A1P33908 653 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PCK1P35558 622 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 CHKAP35790 457 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 SLC7A9P82251 487 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 CYP4F8P98187 520 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 ATP11AP98196 1134 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 TFF2Q03403 129 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 NR1H3Q13133 447 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 MESDQ14696 234 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PPP2R5DQ14738 602 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 BOLA3Q53S33 107 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 C2CD6Q53TS8 623 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 EFHC2Q5JST6 749 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 TXNDC8Q6A555 127 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 SCD5Q86SK9 330 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 UBL4BQ8N7F7 174 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 ACRBPQ8NEB7 543 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 TTC16Q8NEE8 873 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 SHKBP1Q8TBC3 707 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 CLEC4CQ8WTT0 213 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 FGF13Q92913 245 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 OTUB2Q96DC9 234 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 DESI2Q9BSY9 194 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC3Q9BY71 257 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 IL21Q9HBE4 155 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 LZTFL1Q9NQ48 299 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 STIM2Q9P246 746 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 TJP2Q9UDY2 1190 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 NENFQ9UMX5 172 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa10.15□□□□□ -0.78
CTPS1-210ENST00000486889 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 E2F8A0AVK6 867 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 MBTPS2O43462 519 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 PROSCO94903 275 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 LTBRP36941 435 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 CDO1Q16878 200 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 NUDT18Q6ZVK8 323 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 PEX26Q7Z412 305 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 SLFN11Q7Z7L1 901 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 EMC1Q8N766 993 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 ING5Q8WYH8 240 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 AZIN2Q96A70 460 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP57Q96MR6 1250 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 TBCBQ99426 244 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 NPY6RQ99463 290 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 NMUR1Q9HB89 426 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 COX16Q9P0S2 106 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 IGSF9Q9P2J2 1179 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 AMFRQ9UKV5 643 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 CPQQ9Y646 472 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 MYO16Q9Y6X6 1858 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 FAM170AA1A519 330 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC66A2RUB6 948 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf78A6NCI8 922 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF263O14978 683 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 IRAK2O43187 625 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-210ENST00000486889 ECI2O75521 394 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms