RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 PTK7Q13308 1070 aa14.05□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.05□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.05□□□□□ -0.165e-6■□□□□ 8.4
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NISCH-207ENST00000479054 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.05□□□□□ -0.162e-10■□□□□ 10.2
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NISCH-207ENST00000479054 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.04□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.04□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 TOMM70O94826 608 aa14.03□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 PSEN1P49768 467 aa14.03□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 AKAP5P24588 427 aa14.03□□□□□ -0.16
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NISCH-207ENST00000479054 LONP2Q86WA8 852 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-207ENST00000479054 SNX31Q8N9S9 440 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-207ENST00000479054 PPTC7Q8NI37 304 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-207ENST00000479054 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-207ENST00000479054 CD274Q9NZQ7 290 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-207ENST00000479054 FAM153BP0C7A2 387 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-207ENST00000479054 KCNA3P22001 575 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-207ENST00000479054 SGCGQ13326 291 aa14.03□□□□□ -0.16
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