RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ST7Q9NRC1 585 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CACNA1HO95180 2353 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 IRAK2O43187 625 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CACNG3O60359 315 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLKB1P03952 638 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TPM3P06753 285 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC172P0C7W6 258 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADH5P11766 374 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NCAM1P13591 858 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 GJA4P35212 333 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 OPRD1P41143 372 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SOX9P48436 509 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 AMPD2Q01433 879 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 EFEMP1Q12805 493 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTP4A2Q12974 167 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM14Q14142 442 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAF3Q5VWG9 929 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NAA35Q5VZE5 725 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MON1BQ7L1V2 547 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 BNIPLQ7Z465 357 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAC4Q86UU9 113 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 XYLT1Q86Y38 959 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CPXM2Q8N436 756 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF139Q8WU17 664 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 EDEM1Q92611 657 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NT5C3BQ969T7 300 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC39A13Q96H72 371 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SERPINB11Q96P15 392 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCLK3Q9C098 648 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHRDQ9H2X0 955 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM51Q9NW97 253 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFNKQ9P0W0 207 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIK3R2O00459 728 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CBFA2T2O43439 604 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 IRF1P10914 325 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHRNB1P11230 501 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 AVPR2P30518 371 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MATKP42679 507 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZBED6P86452 979 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC6A3Q01959 620 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NR1H3Q13133 447 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MTA1Q13330 715 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRRC32Q14392 662 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 DHCR24Q15392 516 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 HGSNATQ68CP4 663 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 VSTM4Q8IW00 320 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF214Q8ND24 703 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FLCNQ8NFG4 579 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM3CQ92520 227 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 EXOC4Q96A65 974 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 AZIN2Q96A70 460 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 C18orf8Q96DM3 657 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 P2RY11Q96G91 374 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 DNAJC7Q99615 494 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRRX2Q99811 253 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RRN3Q9NYV6 651 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms