RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971		H3BQF6	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971		H3BRJ5	948 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971		H7C4K7	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	AGPS	O00116	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	SGK1	O00141	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	NCAM2	O15394	837 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	MGEA5	O60502	916 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	LILRA1	O75019	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	OAZ2	O95190	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	GJB6	O95452	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ABHD2	P08910	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	KRT10	P13645	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	LCP1	P13796	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	LMO2	P25791	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	IL1R2	P27930	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PHB	P35232	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	FLT3	P36888	993 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ARL4A	P40617	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	HCAR3	P49019	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	RGS7	P49802	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	SULT1E1	P49888	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TKTL1	P51854	596 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	HDAC4	P56524	1084 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	BCAR1	P56945	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	DAOA	P59103	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ROR1	Q01973	937 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	SCAP	Q12770	1279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CBLB	Q13191	982 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	SNX1	Q13596	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	P3H1	Q32P28	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CENPU	Q71F23	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	HSPH1	Q92598	858 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	LPP	Q93052	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PGM2	Q96G03	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	NPY6R	Q99463	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF358	Q9NW07	568 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	PAK5	Q9P286	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFX1-206	ENST00000466971	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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