RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466606.1

EDEM3-205, Transcript of ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3, human

TSL 3

Gene EDEM3, Length 487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SNX27	Q96L92	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	GDF15	Q99988	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	AOX1	Q06278	1338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	KCNQ3	O43525	872 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PBX1	P40424	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DIO1	P49895	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RENBP	P51606	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	GGT6	Q6P531	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	AFF2	P51816	1311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	WDR47	O94967	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	IDE	P14735	1019 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CD19	P15391	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MST1	P26927	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TFF2	Q03403	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	BRD3	Q15059	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DDB2	Q92466	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MUL1	Q969V5	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	LRP6	O75581	1613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PROP1	O75360	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	C1R	P00736	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	EGR1	P18146	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DRD1	P21728	446 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PPM1A	P35813	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RHBDL3	P58872	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MTAP	Q13126	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	GRM1	Q13255	1194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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