RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF34Q969K3 372 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TBCBQ99426 244 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 APOL5Q9BWW9 433 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.842e-6■□□□□ 9.6
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SH3BP4-208ENST00000462602 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 CD207Q9UJ71 328 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT5Q9UKK9 219 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 AMFRQ9UKV5 643 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TRANK1O15050 2925 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC12A8A0AV02 714 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf78A6NCI8 922 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 IRAK2O43187 625 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPSAP2O60256 369 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 MOSPD3O75425 235 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 OLFM2O95897 454 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TBX18O95935 607 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 CKMP06732 381 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 GJA1P17302 382 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 COMTP21964 271 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 WEE1P30291 646 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 CCR1P32246 355 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 AVPR1AP37288 418 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 AIF1P55008 147 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 HDAC4P56524 1084 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TBX4P57082 545 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 GNG11P61952 73 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A9P82251 487 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 RING1Q06587 406 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP2R5DQ14738 602 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TEAD2Q15562 447 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 BOLA3Q53S33 107 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 BRMS1LQ5PSV4 323 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 PEX26Q7Z412 305 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 BNIPLQ7Z465 357 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 MIB1Q86YT6 1006 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 UNC45BQ8IWX7 931 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ITFG1Q8TB96 612 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAM32Q8TC27 787 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-CQ95604 372 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 WDCPQ9H6R7 721 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.842e-7■■□□□ 11.4
SH3BP4-208ENST00000462602 GDE1Q9NZC3 331 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 COX16Q9P0S2 106 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 USTQ9Y2C2 406 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 MDM4O15151 490 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PSTPIP1O43586 416 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 LRCH4O75427 683 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 APOEP02649 317 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT7P08729 469 aa9.77□□□□□ -0.85
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SH3BP4-208ENST00000462602 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 MIPP30301 263 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCR3P49682 368 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC38Q5VT99 294 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PPM1EQ8WY54 764 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PLD4Q96BZ4 506 aa9.77□□□□□ -0.85
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