RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CISD3P0C7P0 127 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 USP8P40818 1118 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NBL1P41271 181 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MRE11P49959 708 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE6CP51160 858 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SGSHP51688 502 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MFAP3P55082 362 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-206ENST00000461017 IQCB1Q15051 598 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SCML4Q8N228 414 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CPA6Q8N4T0 437 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MSANTD3Q96H12 275 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 HSFY1Q96LI6 401 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CPXM1Q96SM3 734 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRX2Q99811 253 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CNGB3Q9NQW8 809 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PLK2Q9NYY3 685 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PI4KAP42356 2102 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NUMA1Q14980 2115 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0A0MRY4 1105 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SYCE3A1L190 88 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PROB1E7EW31 1015 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TK2O00142 265 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 GFRA2O00451 464 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMTOR5O43504 91 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 HRO43593 1189 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 LTFP02788 710 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ERBB2P04626 1255 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MMEP08473 750 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 RALAP11233 206 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ADH5P11766 374 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 UCHL3P15374 230 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-206ENST00000461017 SEC13P55735 322 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 JAM2P57087 298 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MYL5Q02045 173 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-206ENST00000461017 STILQ15468 1287 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 C2CD6Q53TS8 623 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF3Q5VWG9 929 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FYB2Q5VWT5 728 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MSANTD2Q6P1R3 559 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM32Q8TC27 787 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 BHMTQ93088 406 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ST7Q9NRC1 585 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCC13Q9NSE7 274 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO10Q9UK96 956 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-206ENST00000461017 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.33□□□□□ -1.24
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