RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 IRAK2O43187 625 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CEP104O60308 925 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TLR5O60602 858 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 F9P00740 461 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 HOXA9P31269 272 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.634e-18■■■■■ 190.7
NME4-209ENST00000460297 ELMOD1Q8N336 334 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ZNF276Q8N554 614 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 EXD1Q8NHP7 514 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RAPGEF5Q92565 580 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.631e-7■□□□□ 11.2
NME4-209ENST00000460297 CXCR3P49682 368 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 EFEMP1Q12805 493 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 KCNC3Q14003 757 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 BOLA3Q53S33 107 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RASGEF1CQ8N431 466 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 HSPH1Q92598 858 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ANLNQ9NQW6 1124 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.23■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 SZT2Q5T011 3432 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 I6L893 689 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 KRT1P04264 644 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 GBP1P32455 592 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 PPP3CCP48454 512 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ERMARDQ5T6L9 678 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 GAREM2Q75VX8 874 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TEKT4Q8WW24 435 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CORO1BQ9BR76 489 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 DPP7Q9UHL4 492 aa25.22■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 NOTCH4Q99466 2003 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CA9Q16790 459 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 SERPINB11Q96P15 392 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 MAGEB5Q9BZ81 275 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.632e-6■■□□□ 11.8
NME4-209ENST00000460297 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.21■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 LRRD1A4D1F6 860 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 C2orf78A6NCI8 922 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 GABRR2P28476 465 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 HECTD3Q5T447 861 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ACTRT1Q8TDG2 376 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 WDCPQ9H6R7 721 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 FZD10Q9ULW2 581 aa25.2■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 COCHO43405 550 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 CD48P09326 243 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 KDELR1P24390 212 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 ADRA1BP35368 520 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 TUBP50607 506 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 ARSEP51690 589 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 LLGL1Q15334 1064 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 MFSD7Q6UXD7 560 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 MIB1Q86YT6 1006 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 ASAH2Q9NR71 780 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 AP4E1Q9UPM8 1137 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 TLR6Q9Y2C9 796 aa25.2■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 KCTD6Q8NC69 237 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 NTAN1Q96AB6 310 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 SLC39A13Q96H72 371 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 RNF38Q9H0F5 515 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 RNF14Q9UBS8 474 aa25.19■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-209ENST00000460297 FGGP02679 453 aa25.18■■□□□ 1.62
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