RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 XRCC4Q13426 336 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSMD5Q16401 504 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDO1Q16878 200 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BRMS1LQ5PSV4 323 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TTC27Q6P3X3 843 aa9.61□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 JAMLQ86YT9 394 aa9.61□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC89Q8N998 374 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BBOF1Q8ND07 529 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSPH1Q92598 858 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BADQ92934 168 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf74Q96LT6 269 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYRFLQ96LU7 910 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HAPLN3Q96S86 360 aa9.61□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 YME1L1Q96TA2 773 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.61□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDCPQ9H6R7 721 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 WHRNQ9P202 907 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 IRAK3Q9Y616 596 aa9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMAPO00193 183 aa9.6□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00271P0C7V0 271 aa9.6□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC2A3P11169 496 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRT10P13645 584 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR1D2P34982 312 aa9.6□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PPP2R5DQ14738 602 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RASIP1Q5U651 963 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 C4orf22Q6V702 233 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCD5Q86SK9 330 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLD5Q8N7P1 536 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.6□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HCSTQ9UBK5 93 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TET1Q8NFU7 2136 aa9.6□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR27A2RRH5 827 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFAP69A5D8W1 941 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD48P09326 243 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTSAP10619 480 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 IVDP26440 423 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARL4AP40617 200 aa9.59□□□□□ -0.87
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