RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 A6NJR5 290 aa16.58■□□□□ 0.25
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SHQ1-202ENST00000444040 UGT1A9O60656 530 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 RFPL1O75677 317 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 GSTA2P09210 222 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 PDGFRBP09619 1106 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 TPSB2P20231 275 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 TPSAB1Q15661 275 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.58■□□□□ 0.25
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SHQ1-202ENST00000444040 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.58■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.58■□□□□ 0.25
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SHQ1-202ENST00000444040 USP3Q9Y6I4 520 aa16.58■□□□□ 0.25
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SHQ1-202ENST00000444040 KLF11O14901 512 aa16.58■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 AKAP5P24588 427 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 CCNFP41002 786 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.58■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 DTLQ9NZJ0 730 aa16.58■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 A0A0G2JND7 137 aa16.57■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 CSH2P0DML3 217 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 RASSF2P50749 326 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 GPR142Q7Z601 462 aa16.57■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.57■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 PLLPQ9Y342 182 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 HMX2A2RU54 273 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 FAM159BA6NKW6 160 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 KPNA7A9QM74 516 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 GRIA1P42261 906 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42EP1Q00587 391 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 SEMA5AQ13591 1074 aa16.57■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.57■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 HEY2Q9UBP5 337 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.57■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa16.57■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 ARFIP2P53365 341 aa16.56■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.56■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.56■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.55■□□□□ 0.24
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SHQ1-202ENST00000444040 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 VAV1P15498 845 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 GOT1P17174 413 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 ACADSBP45954 432 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 BMPR2Q13873 1038 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 LONP2Q86WA8 852 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 APOL6Q9BWW8 343 aa16.55■□□□□ 0.24
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.55■□□□□ 0.24
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