RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 TRPC3Q13507 836 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 STARD3Q14849 445 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SLC39A14Q15043 492 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 E2F5Q15329 346 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 E2F4Q16254 413 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PTPRNQ16849 979 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 FYB2Q5VWT5 728 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 RDH13Q8NBN7 331 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 HPS3Q969F9 1004 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 MED10Q9BTT4 135 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 GPR174Q9BXC1 333 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PANK2Q9BZ23 570 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 NACA2Q9H009 215 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 TNMDQ9H2S6 317 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 KRT82Q9NSB4 513 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.32□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 UBE4BO95155 1302 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 KNL1Q8NG31 2342 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 MEI4A8MW99 385 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 TNFSF14O43557 240 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 TIMM44O43615 452 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PCDHGA12O60330 932 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 STC2O76061 302 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 KLKB1P03952 638 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 IL12RB1P42701 662 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CYP4F3Q08477 520 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ACOT1Q86TX2 421 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 UNC93AQ86WB7 457 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ADAM32Q8TC27 787 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SDCBP2Q9H190 292 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CUEDC2Q9H467 287 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 NMUR1Q9HB89 426 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.31□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1B0GVT2 93 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CLIC2O15247 247 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CYP26A1O43174 497 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 VNN1O95497 513 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 RARGP13631 454 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC130P13994 396 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PDCP20941 246 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CHKAP35790 457 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 GRK6P43250 576 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 GRIA4P48058 902 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PSEN1P49768 467 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CYP2J2P51589 502 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 KIF11P52732 1056 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 NDST1P52848 882 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 MAP3K7CLP57077 242 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 PDE4CQ08493 712 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ORC1Q13415 861 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CUL4AQ13619 759 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 NCOA4Q13772 614 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 GEN1Q17RS7 908 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 KIF19Q2TAC6 998 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF699Q32M78 642 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.3□□□□□ -1.08
LINC00578-201ENST00000439009 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms