RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ANO7Q6IWH7 933 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 RLN3Q8WXF3 142 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 HPS3Q969F9 1004 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SYT15Q9BQS2 421 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CHD6Q8TD26 2715 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SGK1O00141 431 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 OLFM2O95897 454 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 PDGFRBP09619 1106 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 LHX1P48742 406 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 RBP5P82980 135 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CRY1Q16526 586 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 LCE4AQ5TA78 99 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 BRAPQ7Z569 592 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA18Q8TC71 538 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 WBP2Q969T9 261 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 PCED1BQ96HM7 432 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA17Q96L03 361 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 FNBP1Q96RU3 617 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 INTS13Q9NVM9 706 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 LAMA1P25391 3075 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 NFATC1O95644 943 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 BMP15O95972 392 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 IDEP14735 1019 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 GAP43P17677 238 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 PCSK1P29120 753 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 P2RY2P41231 377 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 PTGER3P43115 390 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ATP1A2P50993 1020 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A9P82251 487 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 RESTQ13127 1097 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 KCNB1Q14721 858 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 DHCR24Q15392 516 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SV2BQ7L1I2 683 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TTC30AQ86WT1 665 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 GPD1LQ8N335 351 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ALLCQ8N6M5 410 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB124Q8NES8 71 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 PIGKQ92643 395 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 GATA6Q92908 595 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 HPDLQ96IR7 371 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 PANK2Q9BZ23 570 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CDH9Q9ULB4 789 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms