RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 FRMD1Q8N878 549 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PIGKQ92643 395 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35C1Q96A29 364 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf47A7E2U8 309 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PATE3B3GLJ2 98 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 NPC1O15118 1278 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF217O75362 1048 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PTGER3P43115 390 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 BCAT1P54687 386 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 NUCB2P80303 420 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 FYB2Q5VWT5 728 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CPXM2Q8N436 756 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCE1Q969G3 411 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ACOX2Q99424 681 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PMM2O15305 246 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZBED1O96006 694 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 KCNA4P22459 653 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R2P41236 205 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TKTL1P51854 596 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF132P52740 706 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 IRX4P78413 519 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 EFEMP1Q12805 493 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 SGO2Q562F6 1265 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 FAM217AQ8IXS0 508 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 UBR7Q8N806 425 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PLD4Q96BZ4 506 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY11Q96G91 374 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH2Q9P0N8 246 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PILRBQ9UKJ0 227 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ACACBO00763 2458 aa22■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFV2P19404 249 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 MFAP3P55082 362 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 BECN1Q14457 450 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 E2F5Q15329 346 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 SCML4Q8N228 414 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 HESX1Q9UBX0 185 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.99■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PSMA7O14818 248 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 SETSIPP0DME0 302 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 VDRP11473 427 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 WASP42768 502 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PDE4CQ08493 712 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 STIM1Q13586 685 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ENPP2Q13822 863 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CEP76Q8TAP6 659 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 BHMTQ93088 406 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CEP63Q96MT8 703 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PLK2Q9NYY3 685 aa21.98■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TULP2O00295 520 aa21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CYBBP04839 570 aa21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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