RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PQLC3Q8N755 202 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf29Q8N999 325 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 E2F7Q96AV8 911 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 HPDLQ96IR7 371 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF333Q96JL9 665 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 KLC2Q9H0B6 622 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF4Q9NR80 690 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 RFPL1O75677 317 aa19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 CSH2P0DML3 217 aa19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC14Q49A88 953 aa19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO27Q8NI29 283 aa19.34■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 CXorf38Q8TB03 319 aa19.34■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 LGSNQ5TDP6 509 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MROH9Q5TGP6 573 aa19.34■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK4Q9NYG8 393 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF180Q9UJW8 692 aa19.34■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 KLC1Q07866 573 aa19.33■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 MPP5Q8N3R9 675 aa19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP3A43Q9HB55 503 aa19.33■□□□□ 0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFAF2Q8N183 169 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 SHCBP1Q8NEM2 672 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf26Q96N11 449 aa19.33■□□□□ 0.68
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SH3BP1-202ENST00000417536 P4HA1P13674 534 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 TGM2P21980 687 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 AMPD1P23109 780 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 AQP5P55064 265 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 PDK2Q15119 407 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHH3Q7Z736 793 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC8Q8IYI6 725 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 RTP4Q96DX8 246 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 KATNBL1Q9H079 304 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT38O76015 456 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL18O95568 372 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 PFKMP08237 780 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-202ENST00000417536 BOLA3Q53S33 107 aa19.32■□□□□ 0.68
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