RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMD14O00487 310 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDH7O60245 1069 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDH8O95206 1070 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 LDHBP07195 334 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARSBP15848 533 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 HDCP19113 662 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD6P30203 668 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALDH1A3P47895 512 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 HK3P52790 923 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFAIP2Q03169 654 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUT7Q11130 342 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEDD9Q14511 834 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCAPHQ15003 741 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLGAP5Q15398 846 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 NTRK3Q16288 839 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM110CQ1W6H9 321 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SV2CQ496J9 727 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLYWCH1Q4VC44 716 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 DACT2Q5SW24 774 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXB2Q5VYV0 432 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAPT1Q6NXT6 567 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOK6Q6PKX4 331 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAQR6Q6TCH4 344 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGFL2Q6UWQ7 119 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 VSTM1Q6UX27 236 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIFABQ6ZNK6 161 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPH6Q7L8W6 267 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 OTOP1Q7RTM1 612 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP52Q8N1V2 620 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 KBTBD3Q8NAB2 608 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10V1Q8NGI7 309 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR14A16Q8NHC5 309 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 POC1BQ8TC44 478 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGAP3Q96P47 875 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCRL5Q96RD9 977 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 IER2Q9BTL4 223 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf226A1L170 272 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAGE12JA6NER3 117 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 LILRA5A6NI73 299 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3QKU1 62 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DS3K7RE56 304 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARVCFO00192 962 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX33O43247 280 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCP110O43303 1012 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOAT2O75908 522 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV4-1P06312 121 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSHP09668 335 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLK2P20151 261 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSSP25774 331 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRIA2P42262 883 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNM2P50570 870 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLCN3P51790 818 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF132P52740 706 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAPSNQ13702 412 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGA9Q13797 1035 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR18Q14330 331 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNB1Q14721 858 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPHA7Q15375 998 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 C15orf32Q32M92 178 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 C6orf10Q5SRN2 563 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASPHD1Q5U4P2 390 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM65Q6PJ69 517 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCDC5Q6ZRR9 648 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPD1LQ8N335 351 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 C7orf31Q8N865 590 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1N1Q8NGS0 311 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM190Q8WZ59 177 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPIPB3Q92617 1050 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PBXIP1Q96AQ6 731 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL32Q96NJ5 620 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIGQQ9BRB3 760 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYL10Q9BUA6 226 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPHA6Q9UF33 1036 aa-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms